Ani mağaraları ve çevresindeki vadiler, ilk olarak 1915 yılında Nikoghayos Mar’ın talimatıyla David Ghipshidze tarafından sistematik olarak incelenmiştir. Araştırma 1916’da kesintiye uğramış, ancak keşif gezisinin bir üyesi olan Nikolai Tokarsky çalışmaya devam etmiştir.

Tokarsky, Ghipshidze’nin çalışmalarına dayanarak, 1972 yılında Yerevan’da D. Ghipshidze’nin yazarlığı altında Rusça olarak “Ani Mağaraları” adlı kitabı yayınlamıştır.

Çalışmalar, Ani mağaralarının sadece yerleşim alanları olmadığını, aynı zamanda dini öneme de sahip olduğunu göstermektedir: Mağaralarda 30’dan fazla kilise ve şapel bulunmuştur.